提取DNA后，利用毛细管电泳方法分别对1852个番荔枝的9个SSR、770个玉米的92个SSR和476个菜豆的36个SSR进行基因型分析，检测结果重复2次以上。
样本多样性的地理模式是利用SSR分型数据集，基于空间位置遗传多样性指数(等位基因丰富度(allelic richness, AR)和预期杂合性(expected heterozygosity, HE))结果获得的。利用STRUCTURE软件来分析样本的群体遗传结构。NJ邻接进化树使用ADEGENET R包计算的Nei遗传距离构建的。
图1、本研究中使用的植物材料及取材地理位置。(a) 1852份番荔枝，(b) 770份玉米和(c) 476份菜豆材料。
图2、样本空间位置整合的预期杂合度值。
图3、番荔枝(a)、玉米(b)和菜豆(c)的STRUTURE结果。
图5、中美洲和南美洲各自等位基因的地理丰富性显示了不同作物之间的差异模式。
